Das MPS ist an zahlreichen Instrumenten der Rosetta-Mission beteiligt: Das Institut hat die wissenschaftliche Leitung beim wissenschaftlichen Kamerasystem OSIRIS (Orbiter), dem Sekundärionen-Massenspektrometer COSIMA (Orbiter) und dem Gasanalysator COSAC (Lander). Zudem ist das MPS an weiteren fünf Instrumenten beteiligt: ROSINA, MIRO, CONSERT, DIM und ROMAP.